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R语言方差分析(ANOVA)学生参加辅导课考试成绩差异

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原文链接:http://tecdat.cn/?p=18087

 

方差分析是一种常见的统计模型,顾名思义,方差分析的目的是比较平均值。

为了说明该方法,让我们考虑以下样例,该样例为学生在硕士学位课程中的最终统计考试成绩(分数介于0到20之间)。这是我们的因变量 。“分组”变量将是学生参加辅导课的方式,采用“自愿参与”,“非自愿参与”的方式。最后是“不参与”(不参加或拒绝参加的学生)。为了形成组,我们有两个变量。第一个是学生的性别(“ F”和“ M”),第二个是学生的身份(取决于他们是否获得许可)。


  
  1. > tail(base)
  2. PART GEN ORIG  NOTE
  3. 112 vol     F      R1 16.50
  4. 113   non_vol.     M      R1 11.50
  5. 114   non_vol.     F      R1 10.25
  6. 115   non_vol.     F      R1 10.75
  7. 116   non_vol.     F   a 10.50
  8. 117 vol M      R1 15.75

在开始多因素分析之前,让我们从单因素分析开始。我们可以查看分数的变化,具体取决于分组变量 


  
  1. > boxplot(base$NOTE~base$PAR
  2. > abline(h=mean(base$NOTE),lty=2,col="re

 

我们还可以根据性别来查看 

> boxplot(NOTE~GEN,ylim=c(6,20))

 

 

在方差分析中,假设 

  指定可能的处理方式(这里有3种)。

我们将考虑对 作为补充假设 。然后,我们将估计两个模型。

第一个是约束模型。


  
  1. > sum(residuals(lm(NOTE~ 1,data=base))^ 2)
  2. [1] 947 .4979

对应于


  
  1. > (SCR0=sum(( base$NOTE-mean( base$NOTE))^ 2))
  2. [ 1] 947.4979

第二,我们进行回归,


  
  1. > sum(residuals(lm(NOTE~PART,data=base))^ 2)
  2. [1] 112 .5032

当我们与子组的平均值进行比较时,就等于查看了误差,


  
  1. >
  2. > (SCR1=sum((base$NOTE-base$moyNOTE)^2))
  3. [1] 112.5032

费舍尔的统计数据


  
  1. > ( F=( SCR0-SCR1)*(nrow(base)-3)/SCR1/(3-1))
  2. [1] 423.0518

判断我们是否处于接受或拒绝假设的范围内 ,可以看一下临界值,它对应于费舍尔定律的95%分位数,


  
  1. > qf( .95,3 -1, nrow( base) -3)
  2. [1] 3 .075853

由于远远超过了这个临界值,我们拒绝 。我们还可以计算p值


  
  1. > 1 -pf(F,3-1,nrow(base)-3)
  2. [ 1] 0

在这里(通常)为零。它对应于我们通过函数得到的


  
  1. Analysis of Variance Table
  2. Response: NOTE
  3. Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)
  4. PART        2 834.99  417.50  423.05 < 2.2e-16 ***
  5. Residuals 114 112.50    0.99
  6. ---

或者


  
  1. Terms:
  2. PART Residuals
  3. Sum of Squares  834. 9946  112. 5032
  4. Deg. of Freedom        2       114
  5. Residual standard error: 0. 9934135
  6. Estimated effects may be unbalanced

可以总结为


  
  1. Analysis of Variance Table
  2. Response: NOTE
  3. Df    Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
  4. PART        2 834.99  417.50  423.05 < 2.2e-16 ***
  5. Residuals 114 112.50    0.99
  6. ---

 

我们在这里可以看到分数并非独立于分组变量。

我们可以进一步挖掘。Tukey检验提供“多重检验”,它将成对地查看均值的差异,


  
  1. Tukey multiple comparisons of means
  2. 95 % family-wise confidence level
  3. $PART
  4. diff       lwr      upr    p adj
  5. non_vol.-non_part.   0.60416 -0.04784 1.2561 0.07539
  6. volontaire-non_part. 6.66379  5.92912 7.3984 0.00000
  7. volontaire-non_vol.  6.05962  5.54078 6.5784 0.00000

我们在这里看到,“非自愿”和“非参与”之间的差异不显着为非零。或更简单地说,假设我们将接受零为零的假设。另一方面,“自愿”参加的得分明显高于“非自愿”参加或不参加的得分。我们还可以成对查看学生的检验,


  
  1. Pairwise comparisons using t tests with pooled SD
  2. data:  NOTE and PART
  3. non_part. non_vol.
  4. non_vol.   0. 03      -
  5. volontaire < 2e- 16    < 2e- 16

如果我们将“非自愿”和“非参与”这两种方式结合起来,并将这种方式与“自愿”方式进行比较,我们最终将对平均值进行检验,


  
  1. Welch Two Sample t-test
  2. data:  NOTE[PART == "volontaire"] and NOTE[PART != "volontaire"]
  3. t = 29. 511, df = 50. 73, p-value < 2. 2e- 16
  4. alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0
  5. 95 percent confidence interval:
  6. 5. 749719 6. 589231
  7. sample estimates:
  8. mean of x mean of y
  9. 16. 66379  10. 49432

我们看到,我们在这里接受了“志愿者”学生的成绩与其他学生不同的假设。

在继续之前,请记住在模型中

在某种意义上说,与对应于同调模型  不依赖分组 

我们可以使用Bartlett检验(该检验将检验方差的同质性)来检验该假设,请记住,如果p值超过5%,则假设“方差齐整性”得到了验证


  
  1. Bartlett test of homogeneity of variances
  2. data:  base$NOTE and base$PART
  3. Bartlett's K-squared = 0. 5524, df = 2, p-value = 0. 7587

更进一步,我们可以尝试对性别进行方差分析的两因素分析,通常要根据我们的分组情况,也可以根据性别对变量进行分析。当均值的形式为零时,我们将讲一个没有相互作用的模型 ,我们可以包括我们考虑的交互

总的来说,我们的模型

其中,按实验处理方式表示与观察到的平均值平均值的偏差,而按组表示与所观察到的平均值平均值的偏差。这样可以通过添加一些约束来识别模型。最大似然估计:

对应于总体平均值

对应于每次实验的平均值(或更确切地说,它与总体平均值的偏差),

最后

我们对一组进行方差分析

对于约束模型,

  和  表示实验次数和组数

方差分解公式在这里给出

我们将进行手动计算,


  
  1. Terms:
  2. PART    GENRE PART:GENRE Residuals
  3. Sum of Squares  834. 9946  20. 9618     3. 4398   88. 1017
  4. Deg. of Freedom        2        1          2       111
  5. Residual standard error: 0. 8909034
  6. Estimated effects may be unbalanced

总结结果


  
  1. Analysis of Variance Table
  2. Response: NOTE
  3. Df Sum Sq Mean Sq  F value    Pr(>F)
  4. PART         2 834.99  417.50 526.0081 < 2.2e-16 ***
  5. GENRE        1  20.96   20.96  26.4099 1.194e-06 ***
  6. PART:GENRE   2   3.44    1.72   2.1669    0.1194
  7. Residuals  111  88.10    0.79
  8. ---

由于实验组与对照组之间似乎没有任何交互作用,因此可以将其从方差分析中删除。


  
  1. Analysis of Variance Table
  2. Response: NOTE
  3. Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)
  4. PART        2 834.99  417.50 515.364 < 2.2e-16 ***
  5. GENRE       1  20.96   20.96  25.875 1.461e-06 ***
  6. Residuals 113  91.54    0.81
  7. ---

从结果可以看到(自愿)参加课程会有所帮助。


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转载:https://blog.csdn.net/qq_19600291/article/details/105658238
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